生命科学データベース横断検索システムの再構築業務 一式（科学技術振興機構様）

全省庁統一資格 役務の提供等／生命科学データベース横断検索システムの再構築業務 一式

生命科学データベース横断検索システムの再構築業務 一式

仕様書(生命科学データベース横断検索システムの再構築業務).pdf

公募説明書(生命科学データベース横断検索システムの再構築業務).pdf

各種様式(生命科学データベース横断検索システムの再構築業務).zip

【本公告に関する問い合わせ先】

東京都千代田区四番町５番地

３　サイエンスプラザ

国立研究開発法人科学技術振興機構 経理部調達室 調達第一課

担当：中村 珠々 TEL:03-5214-79

96　E-mail:keiyakuk@jst.go.jp

参加者確認公募に附する事項

公告日

令和８年９月９日(水)

公告の種類

参加者確認公募

公告番号

調１-2026-108

分任契約担当者

経理部調達室長 近藤 章博

契約担当部署

経理部調達室 調達第一課

調達種別

役務

調達品目

システム設計・開発・改造等

１．当該招請の主旨

生命科学データベース横断検索システム（以下、「本システム」という。）

は、科学技術振興機構（以下、「JST」という。）情報事業部NBDC事業推進室

（以下、「NBDC」という。）が提供する、大学や研究機関等がインターネット

上で公開している生命科学系データベース（以下、「DB」という。）に対し、

各DBの構造に応じた検索インデックスを作成し、ウェブブラウザ上の検索イン

ターフェースを通じて一括検索を可能にするサービスであり、現在はJSTのク

ラウドインフラ（以下、「共通IT基盤」という。）上で稼働している。

本件は、本システムと同等のサービスを提供するシステムを、大学共同利

用機関法人情報・システム研究機構国立遺伝学研究所バイオデータ研究拠点

ライフサイエンス統合データベース部門(以下、「DBCLS」という。)の環境上

に再構築する業務である。なお、「同等のサービス」とは、利用者向け公開

URL、外部公開インターフェース、検索API、検索結果のレスポンス形式及び

関連システムとの接続仕様について、本システムとの互換性が維持されてい

る状態をいう。以下、共通IT基盤上で現在稼働している本システムを「現行

システム」、DBCLS環境上に再構築するシステムを「再構築システム」という。

再構築システムにおいても同等のサービスを維持するためには、受注者は、

現行システムの構成、設定、運用手順、データ構造及び関連システムとの接続

方式を調査し、DBCLS環境において再構築する必要がある。そのため、共通IT

基盤、及びNBDC独自のインフラ上で稼働するNBDC関連システムについての知識

が不可欠である。

また、現行システムでは、検索エンジンとしてElasticsearchを利用してお

り、利用者向け検索機能を実現するための検索インデックスをElasticsearch

内で管理している。インデックスデータ移行にあたっては、必要な全てのデ

ータが現行システムから複製されているか確認し、必要に応じて差分調整を

行った上で移行を実施する必要がある。そのため、現行システムのサーバ構

成、検索インデックス構成、データ更新方式及び運用手順を理解し、現行環

境から新環境への移行に伴うリスク分析及び移行計画を策定できる知識及び実

績が必要である。さらに、Elasticsearchのバックアップ及び復元に必要とな

るバージョン互換性、インデックス構成、クラスタ設定及びリポジトリ設定に

関する知識を有し、新環境への移行する際に発生する技術的課題への対応実績

を有していることが求められる。

もし、これらの知識や実績を持たない事業者が本業務を実施した場合、平

成20年の開発以来蓄積されてきた膨大なインデックスデータの移行及び再構成

が適切に実施できず、インデックスの一部が失われる等により、ユーザに対し

て正しい検索結果を提供できなくなるおそれがある。

さらに、現行システム及びNBDC関連システムに関する十分な知識を有してい

ない場合には、障害発生時におけるDBCLS環境での原因究明や対処の長期化等

のリスクが生じるおそれがある。その結果、DBCLS環境で稼働する他のサービ

スにも影響が及ぶ可能性が高く、DBCLS関係者のみならずDBCLSが提供するサー

ビスのユーザに対しても広範囲かつ重大な影響を及ぼすおそれがある。

特定事業者は、平成20年の開発以来、現行システムの追加開発及び運用・ア

プリケーション保守の全てを担ってきた。したがって、現行システムの最新の

運用状況、NBDC関連システム及び共通IT基盤に関する知識など、本業務の遂行

に必要な知識を十分に有している。さらに、Elasticsearchクラスタ環境におい

て、バックアップ及び復元機能を用いた大規模な検索インデックスデータのリ

ストアを実施した実績を有していることから、現行システム内に存在する膨大

な検索インデックス等のデータをDBCLS環境へ安全かつ確実に移行・反映し、

現行システムと同等のサービスを提供する再構築システムを構築することが可

能である。

以上のことから、特定事業者は本業務を実施できる唯一の者であると判断し、

特定事業者との随意契約が妥当と考えるものであるが、競争性の不存在につい

ての客観的な証明ができないことから参加者確認公募を実施し、公募の結果、

特定事業者以外の者による応募が無い場合に、特定事業者と随意契約を行うこ

ととしたい。

２．調達概要

業務名

生命科学データベース横断検索システムの再構築業務 一式

業務内容

生命科学データベース横断検索システムを大学共同利用機関法人情報・システ

ム研究機構国立遺伝学